Kontakt: tajnica - Dunja Hudoletnjak, email: dhudolet@kbsd.hr tel: 095-3777-175 fax: 01-3712-093OPĆENITO O UZORCIMABitni elementi pri uzimanju i postupanju s uzorcima su:1.odabir ciljanog uzorka ovisno o lokalizaciji i karakteru lezije2.način i tehnike uzimanja uzorka (dekontaminacija, kirurški, konzervativno)3.vrijeme sakupljanja uzorka4.količina i volumen uzorka (ml, gr )5.proteklo vrijeme od časa uzimanja uzorka do primarnog uzgoja 1-2 sata (označiti sat, dan)6.transport uzorka (sa ili bez podloge)7.pohrana uzorka (termostat, hladionik, sobna temperatura)8.prioritet uzorka (krv, likvor, rana)9.parni ili komplementarni uzorci (obrisak endocerviksa + intrauterini uložak, urin + krv, bronhoalveolarni lavat + krv)10.označavanje uzorka i potpis liječnikaRelevantni podaci bitni za mikrobiološku obradu su:•osnovna dijagnoza bolesti•dijagnoza infekcije•primjena antibiotika, kortikosteroida, citostatika i koliko dugoOptimalno vrijeme uzimanja uzorka temeljeno je vrstom infekcije i mogućnostima laboratorija1.dominantno tijekom dana2.najveća koncentracija patogena u uzorku u jutarnjim satima, tada je i volumen uzorka najveći. Rezultat ovisi o volumenu (ml, gr) i broju uzoraka (1-6 i više), jer se uzročnici izlučuju intermitentno i u malom broju3.uzeti više vrsta kompatibilnih uzoraka ( urin + krv, bronhoalveolarni lavat + krv, obrisak + aspirat ili bioptat tkiva)istovremeno uzeti uzorak krvi zabiokemijsko određivanje markera upale (CRP, leukociti)4.istovremeno uzeti uzorak krvi za biokemijsko određivanje markera upale (CRP, leukociti)VRSTE UZORAKAAnatomsko područje i karakter lezije određuju vrstu uzorka, postupke uzimanja, dostavu i pohranu.Razlikujemo: Direktan uzorak:•vrste: krv, likvor, bioptat, aspirat iz organa i tkiva, svih vrsta tjelesnih tekućina, dubokih apscesa•osobitost:fiziološki sterilno područje•patogen: nalazi se u sterilnom području, prisutan u malom broju izolat je uzročnik infekcije•postupci uzimanja: aseptični, nakon dekontaminacije površine, kirurški zahvat. aspiracija iglom•dostava: odmah, bez transportne podloge ili u specifičnoj podlozi (hemokultura) ili fiziološkoj otopini (tkivo) ili hranjivom bujonu (tkivo)•pohrana:osobna temperatura do 2 sataotermostat pri 37°C (u tekućoj podlozi)•obrada: odmah•rezultati:opreliminarni (2-4 sata mikroskop)okonačni (24-72 sata; 5-10 dana uzgoj)Indirektni uzorak:•vrste: ekspektorirani iskašljaj, (sputum), aspirat traheje, srednji mlaz urina. obrisak rane. obrisak endocerviksa, ždrijela•osobitost: patogen se nalazi u sterilnom području i do njega se dolazi kroz područje kolonizirano fiziološkom florom kože i/ili sluznice•patogen: uzorak sadrži patogen, ali i kolonizante- apatogenu fiziološki floru•postupci uzimanja: stupanj kontaminacije uzorka fiziološkom florom ovisi o postupcima dekontaminacije, te uobičajenim ili posebnim tehnikamauzimanja uzorakaosterilni instrumenti (bronhoskop)opriprema bolesnika (urin, rana)odva obriska istovremeno (endocerviks)•dostava: odmah ili unutar 2 sata•pohrana: hladionik pri +4°C iznimno termostat ili sobna temperatura, uz uvjet da se nalazi u transportnoj podlozi•obrada: standardna vrijeme trajanja obrade ovisi o vrsti mikroba vrsti uzorka određivanju osobitosti mikrobaUzorak s fiziološkom florom:•vrste: stolica, usna šupljina•osobitost: patogena i apatogena flora nalaze se na istome mjestu•postupci uzimanja: bitni su postupci uzimanja uzorka, da se smanji količina apatogena, tj. prisutne fiziološke flore•dostava: odmah ili tijekom 2 sata•pohrana: hladionik pri +4° C•obrada: selektivnim uzgojem dokazujemo patogene•rezultat: bitno navesti vrstu pretrage, ako se želi dokazati određeni patogen iz uzorka (npr. Toksin Clostridium difficile iz uzorka stolice)OSOBITOSTI UZORAKAOpćenito:Uzorak mora biti precizno obilježen i zaštićen u nepropusnom spremniku. Uz uzorak se šalje i pripadajuća uputnica s podacima bolesnika, osnovnojdijagnozi, dijagnozi infekcije, dosadašnjoj antimikrobnoj terapiji i vrsti tražene pretrage. Dan uzimanja uzorka je 0 dan obrade. Vrijeme potrebno za uzgoj24-72 sata - 5 dana - 3 tjedna, ovisno o vrsti uzorka, pretrazi, mikrobu. Uzorci se obrađuju slojevito, a obrada se sastoji od: mikoskopskog preparata, zakvantitativno i kvalitativno određivanje upalnih elemenata, uzgoja, kvantitativnog, ovisno o vrsti uzorka i kvalitativnog, ovisno o vrsti izolata saosobitostima, testa osjetljivosti i mišljenja. Jedan jedini uzorak je kao niti jedan. Nesigurne, irelevantne i nekorektne informacije slijede nakon nestručnoguzimanja, pohrane i transporta uzoraka, što dovodi do zablude liječnika, a time i do nepravilne odluke.TEHNIKE UZIMANJA UZORAKAOpćenito:Za mikrobiološku obradu rana bitno je odrediti vrstu uzorka s obzirom na:1.tip rane (kirurška incizija, traumatska, povreda, vrijed noge, kronična rana,dekubitus2.mjesto rane3.kliničke znakove infekcije4.da li je primjenjena antimikrobna terapija, antiseptik, potporni ovoji ili neka druga vrsta potporne terapije (hiperbarična terapija kisikom, vacuumpotpomognuto cijeljenje rane i drugo)Bez obzira na vrstu lezije, prije uzimanja uzorka treba ukloniti površinsku mikrobnu floru, krastu, nekrozu, obilan eksudat. Lezija se ne može potpunoobeskličiti, ali se ukupna količina mikroflore može smanjiti na 20%. (I.M. Miller,1999)POSTUPCI DEKONTAMINACIJE RANE1.Mehaničko čišćenje fiziološkom otopinom - za ispiranje se koristi sterilna fiziološka otopina zagrijana na 37° C, ne starija od 24 sata, u količini od30 ml.2.Čišćenje se vrši pomoću igle i brizgaljke. Potisak mora biti jačine 4-15 PSI (Pounds Per Square Inch ili težina od 435,59 gr. na kvadrat veličine 2.54 cm), igla 19 gange, brizgaljka 35 mL, a vrh igle udaljen 2,5-5,0 cm od površine rane. Jačina mlaza može oštetiti tkivo i instalirati bakterije u njega ilidispergirati mikrobe u okolinu. Čišćenje rane fiziološkom otopinom nema citostatski efekt na tkivo, ne dovodi do odloženog cijeljenja. Primjenjuje se u svim fazama cijeljenja, pri akutnim i kroničnim ranama, te nakon primjene antiseptika.3.Dekontaminacija antiseptikom, ovisi o vrsti rane i fazi cijeljenja4.Primjena antiseptika je ciljana, vremenski ograničena, a procjena individualna u odnosu na bolesnika. Jedina prava indikacija za primjenuantiseptika je akutna faza akutna rane, do početka stvaranja granulacija. Sve ostale indikacije su dvojbena s obzirom na supresiju mikroflore,citotoksično djelovanje na stanice domaćina, te odgođeno cijeljenje rane. Indikacije za primjenu antiseptika donose se u odnosu na individualnogbolesnika i to kod:1.inficirane akutne rane i prisutnog nekrotičnog tkiva2. akutne traumatske povrede3.pri kroničnoj rani u dijabetičara i imunokompromitiranih neutropeničnih bolesnika5.nakon dekontaminacije rane antisepticima, ranu treba isprati sterilnom, zagrijanom fiziološkom otopinom, kako bi se izbjeglo potencijalnocitotoksično djelovanje6.Kirurški debridman ili debridman potpornim ovojimaPOSTUPCI UZIMANJA UZORAKA•Akutna površna incizija ili ranaouzorak uzeti suhim ili u fiziološkoj otopini navlaženim brisom obrisati, ne prečvrsto, dno rane i /ili rubove rane, ostaviti otprilike 30 sekundi dabris upije sadržaj raneopostupak ponoviti sa još jednim brisomoprecizno naznačiti koji je prvi, a koji je drugi brisoako je prisutan sekret u rani, aspirirati sadržaj iglom i brizgaljkom > 1 mlodostaviti u laboratorij unutar 1 - 2 sata po uzimanju u sterilnoj posudici ili brizgaljkiopohrana sadržaja rane ili brisa u transportnoj podlozi moguća do 12 sati pri sobnoj temperaturi (22-25 C)•Akutna duboka (organ, organski prostor,incizija) rana, kronična rana, otvoreni absces, fistulaoeksudat iz lezije aspirirati iglom i brizgaljkom u količini > 1 mlouzorak odmah zatvoriti „kapicom“ (bez igle) ili staviti u transportnu podloguone preporuča se postupak s dva brisaouzorak tkiva se uzima „ punch“ biopsijom sa 3-4 mjesta ili kirurškom biopsijom s dva mjesta ( > 1gr tkiva)obioptat se uzima na granici inficiranog i zdravog tkiva ili iz stijenke abscesaopri fistuli bitno dekontaminirati okolinu lezije, a zatim aspirirati sadržaj s dna lezije ili donje trećine lezijeotransport unutar 1-2 sata po uzimanju u brizgaljki s „kapicom“ ili u sterilnoj posudici sa ili bez fiziološke otopineotransportnu podlogu sa sadržajem i ili tkivom može se pohraniti do 12 sati pri sobnoj temperaturi (22-25 C)•Zatvoreni absces:ouzorak je aspirat iz dubine dobiven punkcijom ili bioptat stjenke abscesa nakon kirurške incizijeouzimanje uzoraka, transport i pohrana identični su kao i kod otvorenog abscesa•Celulitis:ouzorak je aspirat koji se uzima iglom (18-25 gange) i brizgaljkomonakon aspiracije sadržaja navući malo fiziološke otopine u igluosadržaj staviti u sterilnu epruvetuohitan transport tijekom 15 minuta, a očekivani izolat u 25-35% slučajeva•Opekotine:oprije uzimanja uzorka bioptata ili aspirata dekontaminirati ranu i učiniti kirurški debridmanouzeti bioptat s ruba lezije na granici granulacijskog i nekrotičnog tkivaoodmah poslati u laboratorij, ako nije moguće, ostaviti na sobnoj temperaturi.•Dijelovi kosti i drugi intraoperativni uzorci:obioptate staviti u sterilnu posudu i odmah poslati u laboratorijostaviti u transportni bujon, odmah poslati u laboratorij, ako nije moguće ostaviti u termostat ili na sobnoj temperaturi.CILJANI UZORAKpovršna lezija-tkivo, aspirat, dva brisaduboka lezija-tkivo, aspiratkronična rana-tkivo, aspirattlačni vrijed-tkivo, aspiratzatvoreni absces-aspirat, tkivootvoreni absces-aspirat, tkivo (stijenka abscesa)fistula-aspirat iz donje trećine fistule ili sa dnaObrisci su najlošiji izbor uzoraka, jer su mikrobi izloženi isušivanju i kisiku, pa se takav uzorak mora staviti u reduciranu, neselektivnu transportnupodlogu. Anaerobne bakterije ugibaju eksponirane zraku, ali u miješanim uzgojima mogu preživjeti i dulje od 24 sata. Uzorke koje nije mogućetransportirati do laboratorija unutar 1 - 2 sata, treba pohraniti pri sobnoj temperaturi u tekućim transportnim podlogama. Povišena temperatura možeuzrokovati različiti rast nekih mikroba, pa čak i smrt, dok niže temprature mogu uzrokovati porast difuzije kisika. Uzorci rana obrađuju se kvantitativno ikvalitativno, što znači da je moguće odrediti količinu mikroorganizama u rani i prisutnost invazivnih patogena. Pri odabiru obriska kao ciljanog uzorka,rana se može u odnosu na ukupan broj uzročnika odrediti semikvantitativno pri čemu se izrazito gust porast bakterija izražava kao >105 CFU/ml.Odabirom bioptata može se iskazati i kvantitativna količina mikroba što je značajno za interpretaciju izolata u odnosu na kolonizaciju, kritičnu kolonizaciju iinfekciju. Prisutna količina vitalnih mikroorganizama čimbenik je virulencije mikroba. Količina mikroba izražava se kao broj poraslih kolonija u mL ili gramuuzorka. Zbog toga je važno uzeti određenu količinu uzorka, >1,0 gram tkiva ili > 1ml sadržaja.NAJČEŠĆE POGREŠKE IZ KLINIČKE PRAKSE•Nedostatni ili loše popunjeni podaci•Najčešći uzorak je bris:oneadekvatanonije ciljanone pohranjuje se adekvatno•Premala količina uzorka < 1 ml ili < 1 gr•Pojedinačni uzorak•Rijetki komplementarni uzorci•Neadekvatno očitavanje strukturiranog nalaza•Komunikacija ovisi o:oznanjuoiInteresuopoznavanju kliničke problematike, obzirom na anamnezu, status, epidemiološke podatkeoNesporazumi: pitanje vremena, nalaza, konzultantskog mišljenjaAUTOR:Dr.sc. Nastja Kučišec Tepeš, prim.dr.med.Specijalist mikrobiolog